脑部超声成像
摘要
Aleph Neuro宣布通过颅骨超声定位显微镜首次获得活体人脑3D图像,体积分辨率比CT高100倍。该公司开源其成像流程和数据集。
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# 脑部超声成像 — Aleph Neuro
来源:https://alephneuro.com/blog/ultrasound-brain
几年前,一篇论文让我们震惊。它的核心观点是:仅仅通过大脑活动,就能解码一个人正在看什么。
看到双层巴士及其重建图像
看到涉水鸟及其重建图像
看到市场场景及其重建图像
从大脑活动重建所看到的图像——左侧为原图,右侧为重建结果(MindEye(https://medarc-ai.github.io/mindeye/),基于fMRI解码)
这很疯狂,也让人瞥见了读心术未来的冰山一角。不幸的是,这需要一台MRI机器,而它显然无法戴在头上。
事实上,整个脑机接口领域的首要瓶颈就是硬件。目前存在两种极端:要么在头骨上钻孔,将电极插入大脑;要么在头外使用EEG记录脑活动,得到的图像充其量是模糊的。
我们正在打造一种新型硬件,无需钻孔,却能提供MRI级别的脑部细节。
它基于**超声**。利用血管系统与神经元之间的联系——当神经元放电时,更多血液会输送到这些神经元。我们通过头骨发射**超声**波,超声波会从红细胞上散射开来。然后,我们就可以绘制整个大脑中血流和血容量的图谱。
超声波在人类头部中的传播。
我们认为,一个通用的脑机接口需要满足两个条件。第一,必须能够看到大脑的大部分区域。即使使用1000个电极,最多也只能捕捉到0.001%的脑部活动。这对于控制光标之类的狭窄任务来说很好,但思维分布在大脑各处。
第二个条件是细节,即分辨率。EEG和MEG等模态具有很大的视野,但只能捕捉到脑活动的模糊图像。这是根本性的问题,是由电场和磁场的传播方式决定的,而且无法通过扩展到数百万个传感器来解决。
神经血管**超声**——像MRI一样——同时满足这两个条件。其物理特性使得能够记录大脑中多达一百万个独立像素,每个像素小于一毫米。在过去的几年里,当去除头骨时,它已经取得了**出色的(https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0896627321001513)结果(https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.adj3143)**。但挑战在于在头骨完整的情况下实现这一点。
## 首次亮相
今天,我们分享一个里程碑:通过头骨使用**超声**捕捉到的活体人类大脑(据我们所知)最详细的血管图像。
活体人类大脑的重建血管容积图,通过完整头骨成像
我们可以看到大血管、软脑膜动脉和小动脉。这是世界上第一张通过头骨对活体人类大脑进行**超声**定位显微镜成像的3D图像,其体积分辨率比类似CT高100倍¹(https://alephneuro.com/blog/ultrasound-brain#fn-1)。
我们知道,经颅微泡成像除了我们正在研究的内容之外,还有许多其他应用。因此,我们将**开源(https://github.com/alephneuro/braindump)**整个处理流程以及数据集。中风、阿尔茨海默病、创伤性脑损伤等疾病都会在CT和MRI无法分辨的尺度上留下血管特征,我们期望这种分辨率的成像能够应用于它们。
## 微泡处理流程
微泡让我们能够突破衍射极限。通常情况下,**超声**无法区分距离小于一个波长的两个物体——任何更精细的结构都会融合成一个模糊的斑点。
单个微泡会扩散成一个波长宽的斑点,但亚像素拟合将其中心定位在远低于衍射极限的位置
诀窍在于浓度。将微泡稀疏地注入,使它们的斑点不重叠,那么每个微泡的中心就可以被精确地定位,精度远超波长本身。当微泡在血管系统中流动时,我们累积数百万个这样的位置,并将它们叠加成一幅比波长细节更精细的图像。
原始超声只能分辨出几个波长宽的斑点;定位每个微泡的中心能够恢复出下面穿行的血管
这些微泡本身是包裹在脂质壳中的六氟化硫气泡。它们是FDA批准的造影剂,我们在四分钟的采集过程中持续输注它们。这种气体的声阻抗与组织相差很大,因此声音会在每个微泡表面强烈反射——这除了能够实现超分辨率之外,还增强了信号。
微泡中心逐帧连接成轨迹,此处以3D显示。它们的方向和速度描绘了血液在活的微血管系统中的流动。
## 走向无造影剂的神经血管成像
我们的造影增强结果是旅程中的一步。它们让我们对通过完整头骨可以达到的血管细节有了清晰的认识。真正的目标是实现无造影剂的脑部神经血管成像。
两个趋势让我们有信心实现这一目标。第一个是硬件。**超声**设备曾经售价超过10万美元,需要一整套电子设备。得益于Butterfly等公司,现在它们的价格和尺寸与智能手机相当,并且还在不断改进。
第二个是数据。无造影剂成像更难。红细胞的散射远小于微泡,因此信号更弱。但信号并没有丢失。只是当今的方法无法提取出来。一个标准的**超声**探头每小时接收TB级的数据,但典型的处理流程会将其压缩到原始数据的0.1%。它基于手工设计的特征,让我们想起了早期的计算机视觉。我们相信,端到端的机器学习,在足够大的数据集上训练,将能够恢复出比当前方法所能看到的更多的信号。
这就是为什么我们目前正在收集我们认为的世界上最大的神经血管**超声**数据集。我们很兴奋地分享接下来的进展。
## 注释
1. 但请注意,这是利用了超分辨率的技巧,这仅适用于造影版本的神经血管超声。↩(https://alephneuro.com/blog/ultrasound-brain#fnref-1)
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