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KG-TRACE 是一个神经符号框架,它将 WHO 突变知识图谱与神经基因组模型相结合,用于抗菌药物耐药性预测,实现了高准确率,并引入了生物基础比率(BGR)指标,以确保与已建立的生物学知识保持一致。
BioManus 是一个 MCP 原生生物医学智能体系统,它采用基于图脚手架的规划方式,对结构化生物学能力进行调度,而非依赖扁平化的基于提示的工具检索,在生物医学基准测试中实现了更优的上下文效率与执行精度。该系统引入了 BioinfoMCP 编译器,用于标准化异构生物信息学工具,并将其组织为类型化异构 MCP 图,以支持可扩展的推理能力。
GiG是一个知识图谱调制的深度学习框架,它将生物知识图谱整合为边,患者特定数据作为节点特征,在有限样本临床任务中性能比现有最佳方法高出高达49%。
本文表明,在编码器适配过程中从掩码语言建模(MLM)切换至因果语言建模(CLM),能够提升在生物医学文本上的下游任务性能。作者发布了 ModernBERT-bio 和 ModernCamemBERT-bio,作为当前最先进的生物医学编码器。
MIT发布了FINGERS-7B,这是一个拥有70亿参数的多组学基础模型,基于3万人的数据进行训练,旨在提前数年预测阿尔茨海默病的风险。该模型可通过AD Workbench访问,并附有发布在OpenReview上的研究论文。
本文介绍了 NATD-GSSL 框架,用于评估图自监督学习在含噪声的文本驱动生物医学图上的鲁棒性。研究表明,尽管存在现实世界的噪声,某些 GNN 架构和 pretext tasks(辅助任务)仍能保持性能,为在不完美数据集上进行无监督学习提供了实用指导。
研究人员使用QLoRA与GraphRAG对BioMistral-7B进行微调,构建面向南非结核病诊疗的LLM,在上下文对齐方面优于基座模型。
LogosKG 提出一种贴合硬件的框架,可在含十亿条边的知识图谱上实现可扩展、可解释的多跳检索;通过度感知分区与按需缓存提升效率,同时不损失保真度。