genomic-foundation-models

本文介绍了一种残差化与置换诊断方法，用于从基因组基础模型的调控重要性分数中分离由可预测性驱动和由调控驱动的方差，并应用于胶质瘤相关位点的暗基因组元件。

TaxDistill提出了一种知识蒸馏框架，使用拥有5亿参数的基因组基础模型（GenomeOcean）作为教师模型，通过减少相似性搜索工具带来的标签噪声来改进宏基因组分类注释，在CAMI2数据集上实现了显著的F1分数提升。