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本文介绍了EquiFiLM,这是一种轻量级扩展,通过特征线性调制向等变基础机器学习力场添加连续外部条件,以极少的训练数据实现了显著的精度提升。
MDForge 是一个 LLM 智能体,可自动化设计用于主客体结合自由能计算的分子动力学流程,取得了与人类专家相当的结果,并发现了一种新型高亲和力结合物。
来自MIT、华威大学和NVIDIA的研究人员提出了Stein核化分子动力学(SKMD),这是一种增强采样方法,利用相互作用粒子动力学为机器学习原子间势(MLIPs)的主动学习和微调获取信息丰富的训练构型。SKMD是Stein变分梯度下降的随机变体,专为分子动力学进行了适配,在保持Boltzmann分布的同时,以更少的训练迭代次数实现了比基线方法更高的模型精度。
EvoMD-LLM 将反应性分子动力学轨迹重构为符号时间序列,使 LLM 能够通过微调和时间支架对物种随时间的演化进行建模,最高可达 66.14% 的准确率并提供可解释的预测。
本文提出了一种面向机器学习粗粒化分子动力学的Hessian匹配框架,该框架通过随机Hessian-向量积匹配增强力匹配,将二阶曲率信息注入CG势能。该方法在快折叠蛋白质的慢模式指标上,KL散度最高降低了85%。