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曲率感知势能面用于蛋白质-配体结合亲和力预测

arXiv cs.LG · 23小时前 缓存

本文提出CPES,一种曲率感知势能面图神经网络,用于蛋白质-配体结合亲和力预测。它整合了物理启发的曲率表示来建模构象灵活性,并在基准数据集上实现了改进的预测性能。

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大规模数据集与基准:蛋白质-配体模型学习的是结合位点还是仅仅结合可能性?

arXiv cs.LG · 2026-05-26 缓存

介绍了InteractBind,一个用于细粒度评估蛋白质-配体模型的大规模数据集和基准,重点关注结合位点定位和非共价相互作用预测。评估了八个现有模型,发现尽管二元结合预测表现强劲,但结合位点定位能力有限。

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