2023年,我使用了SAM1结合自定义vit分类器来识别并自动化我的显微镜图像分割。

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摘要

作者分享了一种使用SAM1和SAM3.1自动化显微镜图像分割的方法,通过分组相似图像并利用类似视频的传播,实现了100%的准确率。

2023年,我使用了SAM1结合自定义vit分类器来识别并自动化我的显微镜图像分割。 如今,SAM3.1可以零样本完成这一任务。(差不多是这样) 从这类图像中提取掩模的困难在于它们充满了其他你不需要的杂物。如何引导模型只提取你感兴趣的物品,而不是其他类似物体的东西? 你可以逐一点击每张图像来获取漂亮的掩模,但这很耗时,所以试图做得更好。 尝试了很多方法后,一件酷事出现了。你可以利用显微镜图像之间存在的微小相似性来欺骗模型,使其传播物体掩模,就像处理视频一样。 最终的最佳方法成功分割了100%的图像。 > 按SSIM相似度对图像进行分组 > 给模型一个单点提示 > 在组“视频”上进行传播 > 使用第一组的2-3张重叠图像作为提示,在第二组中进行传播 > 继续在各组之间跳跃 > 建立你所在上下文中已知的故障标志(空掩模、大小阈值、位置阈值等) > 失败的图像重新分组直到通过 就这样。一个简单的算法就自动化了任务! 通过每张图像的文本提示(结合提示优化)也实现了100%的分割。但许多图像包含了误报(多掩模),这些没有被自动过滤掉。这种单ID视频方法强制模型返回单个掩模,而我们的提示则针对感兴趣的物体。 我喜欢如今的模型通过一点点程序优化魔法就能解决你的问题 :) 不过,分割质量还不太理想,正在研究中
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缓存时间: 2026/08/24 16:00

2023年,我结合SAM1与定制的Vision Transformer分类器来识别和自动分割显微镜图像。

如今,SAM3.1已经能实现零样本学习。(差不多算吧)

从这类图像中提取掩模的难点在于,图像里充斥着各种无关杂讯。如何引导模型仅提取你感兴趣的目标,而非其他类物体的干扰项?

逐张点击图像确实能获得精美掩模,但这极其耗时。我尝试寻找更优解。

经过多种方案测试,一个巧妙方法浮现:利用显微镜图像间存在的微小相似性,诱导模型像处理视频流那样进行目标掩模传播。

最终优化方案实现了100%的图像分割:

按SSIM相似度对图像进行分组 为模型提供单点提示 在该组“视频“中进行传播传播 取首组的2-3张重叠图像作为提示,在第二组中继续传播 持续跳跃处理各组 设置符合场景的失败标识(空掩模、尺寸阈值、位置阈值等) 未通过的图像重新分组直至达标

就这样!一个简单算法就能自动化整个流程!

逐张图像进行文本提示(结合提示优化)同样能达到100%分割率。但许多图像会产生误识别(多重掩模),且无法自动过滤。而单目标ID视频传播法强制模型返回单一掩模,我们的提示精准锁定目标对象。

我欣赏当今模型结合少许编程优化魔法就能解决问题的能力 :)

不过分割质量尚有不足,正在深入研究

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