NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit 在 Claude Science 中为生命科学研究人员带来加速 AI

<div id="bsf_rt_marker"></div><p><span style="font-weight: 400;">生命科学已进入计算规模化时代，十多年来，NVIDIA 构建了完整的 GPU 加速计算堆栈——涵盖硬件、框架、库、模型、微服务和领域特定工具——以帮助研究人员运行更复杂的工作流程并加速迭代。</span></p> <p><span style="font-weight: 400;">本周，Anthropic 宣布了 <a target="_blank" href="https://www.anthropic.com/news/claude-science-ai-workbench">Claude Science</a>，一个面向科学研究的 AI 工作台，让科学家能够以自然语言与智能体对话，从而端到端地运行他们的工作。</span></p> <p><span style="font-weight: 400;">Claude Science </span><span style="font-weight: 400;">集成了 </span><a target="_blank" href="https://nvidianews.nvidia.com/news/nvidia-launches-bionemo-agent-toolkit-giving-ai-agents-the-tools-to-accelerate-scientific-discovery"><span style="font-weight: 400;">NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit</span></a> <span style="font-weight: 400;">作为科学家可以在其工作流程中访问的资源。</span><span style="font-weight: 400;">该工具包将 NVIDIA 加速能力封装为可调用的技能，使 Claude Science 能够选择合适的工具、准备有效输入并执行工作流程——同时连接到部署在任何地方的 NVIDIA 计算资源。这直接将 NVIDIA 的加速模型、库和 NVIDIA NIM 微服务带入了其他研究发生的同一环境。</span></p> <p><span style="font-weight: 400;">全球最大的制药公司正在使用 NVIDIA 技术推动药物发现、基因组学、医学影像、分子设计和蛋白质工程等领域的 AI 赋能研究。如今，前 20 大制药公司中有 18 家使用 </span><a target="_blank" href="https://github.com/NVIDIA-BioNeMo"><span style="font-weight: 400;">NVIDIA BioNeMo</span></a><span style="font-weight: 400;">，这凸显了其在生态系统中的广泛作用。</span></p> <h2><b>推动科学发现的 Agent 时代</b></h2> <p><span style="font-weight: 400;">Claude Science 让科学家能够使用自然语言将他们的研究从意图转化为行动，而无需手动配置模型、端点或软件环境。NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit 通过提供对加速工作流程和模型（如 Evo 2、Boltz-2 和 OpenFold3）的访问，进一步扩展了这种能力，使受益于加速的分析运行得更快。</span></p> <p><span style="font-weight: 400;">科学家首先用自然语言描述研究任务，例如分析基因组序列、预测蛋白质结构或设计潜在结合物。Claude Science 解读请求，并通过预配置的领域专业智能体来协调工作，这些智能体了解基因组学、蛋白质组学、单细胞分析、化学信息学和临床研究中的既定工作流程。</span></p> <p><span style="font-weight: 400;">BioNeMo Agent Toolkit 为这些智能体提供所需的上下文，以便将每个步骤与适当的 NVIDIA 科学能力连接起来。每个技能都包含关于其目的和所需输入的信息，帮助智能体准备和执行工作流程，并返回输出以供审查。</span></p> <p><span style="font-weight: 400;">结果就是在科学推理和加速计算工作之间形成了一个迭代循环。科学家可以检查输出、优化问题、确定下一步，同时始终专注于科学本身。</span></p> <p><span style="font-weight: 400;">一个有力的例子是生成针对常见癌症靶点的更好抑制剂。在此工作流程中，科学家从已知的致癌抗原突变开始，要求 Claude 设计大量潜在抑制剂。集成了 BioNeMo Agent Toolkit 和 NVIDIA NIM 微服务的 Claude Science 加速了高通量抑制剂预测、优化和验证。</span></p> <h2><b>面向智能体的科学基础</b></h2> <p><span style="font-weight: 400;">AI 智能体能够推理、规划并使用工具完成任务。在生命科学领域，这些工具通常是专门的计算工作流程。</span></p> <p><span style="font-weight: 400;">一个自主的 AI 科学家智能体并非孤立地推理。它可能需要为化合物库生成指纹、聚类有前景的候选物、为顶级候选物生成构象、分析基因组背景、比较扰动响应，然后推荐下一步实验。</span></p> <p><span style="font-weight: 400;">每一步都依赖科学工具，智能体的工作速度只能和这些工具的运行速度一样快。</span></p> <p><span style="font-weight: 400;">NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit 为科学智能体提供了它们所需的加速工具，使其能够以科学的速度运行。它包括：</span></p> <ul> <li style="font-weight: 400;" aria-level="1"><a target="_blank" href="https://docs.nvidia.com/clara/parabricks/latest/overview.html"><span style="font-weight: 400;">NVIDIA Parabricks</span></a><span style="font-weight: 400;"> 将基因组分析从数小时缩短到数分钟，使智能体能够近乎实时地将基因组背景整合到决策中。</span></li> <li style="font-weight: 400;" aria-level="1"><a target="_blank" href="https://rapids-singlecell.readthedocs.io/en/latest/"><span style="font-weight: 400;">RAPIDS-singlecell</span></a><span style="font-weight: 400;">（由 scverse 开发）将包含 130 万个细胞的预处理和聚类工作流程从 52 分钟压缩到 25 秒，使单细胞分析成为推理循环的一部分，而不是离线的批量作业。</span></li> <li style="font-weight: 400;" aria-level="1"><a target="_blank" href="https://github.com/NVIDIA-BioNeMo/nvMolKit?ncid=so-link-338451"><span style="font-weight: 400;">nvMolKit</span></a><span style="font-weight: 400;"> 将相似性搜索和构象生成等化学信息学操作加速高达 3,000 倍，使在巨大化学空间中迭代的智能体能够以思考的速度获得结果。</span></li> <li style="font-weight: 400;" aria-level="1"><span style="font-weight: 400;">NVIDIA BioNeMo </span><a target="_blank" href="https://github.com/NVIDIA-BioNeMo#models"><span style="font-weight: 400;">开放模型</span></a><span style="font-weight: 400;"> 提供由 NVIDIA 库加速的核心生物分子能力，使智能体在工作流程的每一步都有专门构建的科学模型可用。</span></li> <li style="font-weight: 400;" aria-level="1"><span style="font-weight: 400;">BioNeMo </span><a target="_blank" href="https://github.com/NVIDIA-BioNeMo#optimized-inference-and-deployment"><span style="font-weight: 400;">NIM 微服务</span></a><span style="font-weight: 400;"> 将这些模型打包为企业级推理端点——容器化微服务，预集成完整的加速软件堆栈并针对高性能推理进行调优——使智能体能够调用一个稳定的应用程序接口用于生产部署。</span></li> </ul> <p><span style="font-weight: 400;">NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit 是开放且与框架无关的，允许相同的科学技能跨不同的智能体框架和研究平台工作。该工具包及其技能现在可通过 <a target="_blank" href="https://developer.nvidia.com/industries/healthcare?size=n_12_n&amp;sort-field=featured&amp;sort-direction=desc">NVIDIA 开发者资源</a> 和 </span><a target="_blank" href="https://github.com/NVIDIA-BioNeMo/bionemo-agent-toolkit"><span style="font-weight: 400;">GitHub</span></a><span style="font-weight: 400;"> 获取。</span></p> <p><span style="font-weight: 400;">科学家可以通过 Anthropic 的 Claude Science 访问 BioNeMo 驱动的工作流程，该平台于今日进入公开测试阶段。作为公开测试的一部分，Anthropic 正在邀请</span></p>