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摘要

本文介绍如何使用Obsidian结合Codex/CC等AI工具构建学术文献管理系统,实现文献自动分类、查重、生成wiki页面和学术工具箱,并分享阅读文献和提升学术能力的方法。

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缓存时间: 2026/06/18 00:04

丢掉你所有的学术skill,你唯一需要的只有Obsidian+CC/Codex/同类产品

可以说当前的99%的学术skill,都是垃圾。

除了新鲜感,其他什么都不剩下。

1. 这套组合能干什么?

你把文献扔进文件夹,告诉 AI 归档:它会执行两步。

Step 1 — 先分析:读完所有文件,输出每篇的知识类型 / 关联现有页面 / 矛盾点 / 建议学科文件夹。不写任何文件,新文件夹需用户确认。

Step 2 — 再执行:分类 → 查重(FATAL-006)→ 移动文件 → 建研究页 → 更新 topic 页 → 更新工具箱 → 更新 index + log → 更新 overview → 汇报。

最终生成你需要的东西:文章的wiki页面+学术方法学工具箱。

2. 怎么安装:

将你的Obsidian文件夹和Codex连接后,把下面库里的md文件喂给你的Codex:

https://github.com/NoNightWatch/Obsidian-Codex-CC-for-academy

让它跟着文件内容设置。

最好给学术内容单开一个库

3. Reference:

https://gist.github.com/karpathy/442a6bf555914893e9891c11519de94f

AI最严厉的父亲@dashen_wang·Apr 28 Article拆解与重组:AI文明运行的底层操作系统没有人告诉过你这件事,但它一直在发生。 每一次人类向前跳跃,都不是因为发现了新东西。是因为有人把旧东西拆开了,然后用一种没人用过的方式重新装回去。 这是文明的底层动作。从来都是。…13184422K

4. 安装说完了,现在来说说怎么使用:

你把文献丢进 raw/inbox/,告诉它「归档 inbox,并更新学术工具箱」。

它自动分类、移动文件、生成 wiki 页面、建立交叉引用、更新索引和日志。

一篇论文进来,可能同时更新十几个相关页面。

5. 可以额外干什么?

依赖这个学术库,可以在固定的文章范围内回答你提出的问题;毕竟大部分文章不OA,一般AI无法给出较为相关的文章。

可以根据你的 research protocol 推荐给你适用的方法,和大致的实验周期

其他玩法,就等你自己探索了

6. 工具只是工具,改变不了质量

知识库和收藏夹是差不多的,只是它被AI赋能了,自动化了一点,能回答你的问题。

但是如果你的文章质量不佳,你随便往里塞,没有你的原则,或者你分不清好坏,那么最后也只是一个高级收藏夹。

所以挑选好的文章,提高你的数据库质量很重要

7. 先吃透基础,再看文献

一个领域最重要的首先是定义:

例如你研究 Topic A,

那么A 是在什么时候 由 xx1 最先提出?xx1怎么定义A的?xx1在文章中对于A的定义的根据是什么?A又是由什么演化而来的?

在xx1之后,A的定义是否有演化?是否有人质疑,有人补充? 有没有xx2提出A1(新A)的定义?

A是否有歧义,以A命名的定义,是否实际分为A1,A2,A3等不同版本? A1,A2,A3实际上是什么? A1,A2,A3谁更能全面的,客观的描述A?为什么?

是否存在 xx1在提出A定义以后;xx1自己否定了A定义,提出了A1定义;但是由于A定义太过出名,而成为范式。但实际上A不如A1客观、正确。 是否有最新的文章混淆A和A1?或者在A1出现后,没有及时跟进理论,仍然在讨论A的不足?但是这些不足已经在A1中被补足了? 又或者认为A就是最新的定义?并且忽视了,或者没了解过A1?

接着是方法

依然以Topic A为例子,

方法a1 :在什么时候,由谁提出?

在其方法定义中,定义a1测量的是什么?

实际操作过程中观测得到的(a2)又是什么? a1 是否直接等同于 a2? 如果不等同,那么误差从何而来?

如果a2需要经过设备测量,则存在一个a3。那么a3是否等同于a2? 如果不等同,那么误差从何而来?

最终,a1、a2、a3 三者是否指代同一对象?

方法a2 :同上,不赘述。

然后是方法论:

依然以Topic A 为例子,

如果 对于 A 定义,存在着方法a1 和 a2, 哪个方法更能反映 更贴近 A? 哪个方法观测得到的对象 更贴近A? 差异是什么?优缺点是什么? 在什么情况下用什么更优? 是否有条件,材料,样品等限制?

如果对于 A,存在A1,A2定义 和 a1 ,a2方法。 哪个方法对应哪个定义? 哪个更优?又或者根据细分定义A1,A2 需采用不同方法?

方法a1,a2在使用过程中,是否忽略什么实际存在的条件、干扰、或者过于理想化?

最终,什么情况下 该用什么方法?为什么?哪个最优?哪个有局限?误差从何而来?等等

最后是自变量、因变量

依然以Topic A 为例子,

什么因素变化会影响A?

A变化会不会影响其他因素?

其他的,根据自己的学科调整吧~

8. 基础夯实了,然后可以开始挑选文献了

堆数据的不算好文章,逻辑紊乱不算好文章,基础理论不扎实的不算好文章

所以好文章是很少的,即便是正刊、子刊,也依然有逻辑紊乱、基础理论不扎实的文章,不奇怪。

看文献的流程,我个人没太注意过,但是最近讨论比较火热的是:

https://web.stanford.edu/class/ee384m/Handouts/HowtoReadPaper.pdf

总结见:https://x.com/paperpaper886/status/2066148829439861016?s=20

我个人的顺序大概是:

标题,

摘要,

引言(具体看定义和假设),

结果(看数据、看图表,这里要总结出你自己的结论),

讨论(对照你自己总结出的结论,检查是否有客观论述结果、是否有避重就轻、是否有逻辑不顺、是否有基础理论不扎实、是否论述局限性、是否有瞎扯结论),

方法(用的对不对、合不合理)。

仅供参考

大概看个10~20篇,你就能分得清好坏了。

某些机构、研究所、高校在某些方向上的研究是很烂的,记下来。

如果某个单位一直很烂(2~3篇 paper),那后续相关方向的文章就没必要看这个单位了。

当然你也会发现有趣的八卦: 某一篇paper突然写的很好 很精妙,那大概是来了个冤大头。

毕竟,龙生龙 凤生凤 老鼠的儿子会打洞。

9. 杂项

睡觉、吃饭、身心健康是第一的,你得先是你自己,然后才是你父母的孩子、某人的伴侣……最后才是课题组里的学生

优先毕业,毕业后有很长的时间足够实现你的理想,你的学术抱负

不开心就别读了,沉默成本不参与重大决策

照顾好自己 照顾好自己 照顾好自己

多出去走走,别整天闷在实验室里

不开心就吃点甜的,节假日好好玩

写作风格,是要打磨的,但是也可以从你的文献库蒸馏,这点不担心。

某些词语,同一个意思,但是不同领域之间的用词不同,AI生成的时候会随便套用,文献库可以帮它定向,缩小范围。

对于某些TOP期刊,不要根据peer reviewer的comments 一条条唯唯诺诺的改。 编辑要看的是,你是否能面对一个无理的reviewer 在保持文章主旨的前提下有力的防御你的观点,而不是reviewer 说什么就是什么,最后把文章改的四不像,那样一样会被拒稿。 实话说,傻逼的reviewer 不少,但是没人了,只能安排傻逼了。

少安排你的学生帮你干杂活,科研是你自己的绩效,是你自己的事;别把自己的科研压力和学生的毕业绑定,没能力就滚蛋,压迫学生 想idea 做研究 发文章,那不是你的能力。三年的硕士生涯,一年上课,一年实习找工作+毕业论文,还有一年能做什么科研?让孩子轻松毕业吧。

10. 后记

所有的工具和手段,都是为了你的目的服务。

你如果只是要毕业,那么这些工具大概够你用了;但如果你要做出好研究,那么多少要下点功夫。

但是,每个人都有自己的路要走,不论是 生活、工作、人生;不必去羡慕别人,走好自己脚下的路,属于你的胜利终究会到来,不要迷失了自己。

最后的最后,

写这篇文章的初衷是帮助学生能够更轻松的完成科研,更轻松的毕业。

而不是让某些畜生同行(高校教职)把这篇文章丢给学生,然后说:

“去读一下这篇文章,下周总结汇报给我。”

**如果最后是这样:

你肩膀上的肿瘤是不是只有增高这一个作用了?**

文献都不读,当你妈的高校教职呢?

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