Show HN：我将850万篇研究论文映射成一个互动地图集

当我看论文时，我不得不在多个标签页之间切换来查找数据集、代码、视频、同行评审等。我尝试通过这个项目来解决这个问题。<p>它最初只是一个针对arXiv上论文的项目，但在Twitter上取得初步成功后（获得了大约1900次浏览：这是我发布的帖子中浏览量最高的一次），我现在已经将其扩展，纳入了来自PubMed Central、bioRxiv、medRxiv和eLife的其他开放获取论文。这些论文已与其基因、蛋白质、疾病、药物、临床试验、3D蛋白质结构、代码以及引用和相似论文进行了关联。<p>这个项目现在包含四个部分：<p>第一部分：一个地图。我使用SPECTER2对近850万篇论文进行了嵌入，运行UMAP进行二维表示，并将它们渲染为散点图。点击这些点可以查看论文的简要信息，例如LLM摘要、关键发现、同行评审、关联实体等。聚类也有标签，尽管可能需要放大才能看到。<p>第二部分：我为每篇论文构建了一个详细的论文页面。它们提供了论文的全文、图片、视频、同行评审（来自OpenReview）、GitHub链接、Hugging Face数据集/模型链接、临床试验、基因、疾病、3D蛋白质结构、引用论文和相似论文。您还可以将整个页面（包括论文全文和图片URL）复制为markdown格式，供您的LLM使用。<p>第三部分：我发布了一个扩展程序，您可以通过点击出现在arXiv、PMC、bioRxiv、Google Scholar或medRxiv上的'open in Tomesphere'按钮，在侧边栏中阅读所有这些信息。我尽力在扩展中提供尽可能多的信息，不过对于查看所有图片或3D蛋白质结构等内容，您可能仍需通过扩展中提供的链接跳转到论文页面。<p>第四部分：所有这些数据均可通过MCP供您的LLM使用。MCP有50次查询的免费限额（注册后可提升10倍）。<p>注意：该项目仍处于测试阶段，因此论文可能包含一些信息不匹配的情况。我很快将推出反馈表格以改进数据质量。非常感谢您花时间阅读本文。