@SylvainGariel: 我花了一段时间才弄清楚大家对ESMFold2的热议是怎么回事。起初,基准测试数据看起来并不特别突…
摘要
ESMFold2是一个用于蛋白质结构预测的开源AI模型,在蛋白质相互作用和抗体方面达到了最先进的性能,并拥有庞大的结构数据库(ESM Atlas)。
我花了一段时间才弄清楚ESMFold2为何引起热议。起初,基准测试数据在我看来并不特别突出,但结果发现有很多令人印象深刻的地方:
- 完全开源,开放权重 + 庞大的ESM Atlas(11亿个结构,而AF3只有2亿个)。
- SOTA
查看缓存全文
缓存时间: 2026/05/30 08:10
我花了好一会儿才搞清楚大家对ESMFold2的热议是怎么回事。起初,我觉得基准测试数据并不特别引人注目,但结果发现它有许多令人印象深刻的方面:
- 完全开源、开放权重,外加庞大的ESM Atlas(11亿个结构,而AF3只有2亿个)。
- SOTA
Alex Rives (@alexrives): 今天,我们宣布推出ESMFold2,一个开源的科学引擎,用于推动蛋白质生物学领域的预测、设计和发现。
新模型在蛋白质相互作用方面达到了最先进性能,尤其是在抗体方面——抗体是治疗药物的关键模式。
我们已
相似文章
Biohub/esm
Biohub 发布了 ESMC、ESMFold2 和 ESM Atlas——一个用于蛋白质生物学的世界模型,能够实现跨尺度的最先进预测、设计和发现,包括一个包含十亿结构的图谱。
结构蛋白质组学引导的共折叠模型
介绍了AIMS-Fold,一种推理时引导扩散框架,整合了交联质谱(XL-MS)和氢-氘交换(HDX-MS)数据,以改善针对诱导接近药物靶点的蛋白质共折叠预测。
@THayes427: 另外请查看这个@modal教程,它详细讲解了上面笔记本中的底层代码,并提供了更多详细解释…
一个Modal教程,展示如何使用ESMFold2和ESMC模型扩展蛋白质绑定剂设计,包含用于迭代优化和自动伸缩基础设施的代码。
折叠、推理与扩展:开源药物发现引擎
介绍OpenDDE,一个开源的全原子生物分子基础模型,该模型利用共折叠作为药物发现的共享结构推理层,实现了高精度,并识别出用于进一步改进的缩放定律。
@SilkyDogfish:非常激动地发布我们来自 @Angstrom_ai 和 @AstraZeneca 合作的论文,评估我们的新模型……
Ångström AI 与 AstraZeneca 的合作推出了 CSP-MACE-Å,这是一种旨在替代晶体结构预测(CSP)中 DFT 的机器学习原子间势,以低得多的计算成本实现了相当的精度。