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本文介绍了 PROBE,一个利用 LLM 代理通过在编辑前探测口袋-配体复合物响应来迭代优化基于结构的药物设计中的配体的框架,其在 CrossDocked2020 上取得了最先进的结果。
介绍了AIMS-Fold,一种推理时引导扩散框架,整合了交联质谱(XL-MS)和氢-氘交换(HDX-MS)数据,以改善针对诱导接近药物靶点的蛋白质共折叠预测。
本文正式将基于转录组的药物设计(TBDD)形式化为一个生成式逆问题,并提出了CURE——一个多分辨率转录组引导的扩散框架,能够生成以所需转录组状态转变为条件的药物分子。