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TracingFlow是一个无模拟框架，使用二阶动力学进行轨迹推断，提高了在单细胞组学数据中捕捉高曲率转变的准确性。

SpaCellAgent 是一个自进化的大语言模型多智能体框架，能够从自然语言查询自动执行端到端的时空轨迹分析，实现分析效率提升超过40%，同时保持专家级别的性能。

CellBRIDGE是一种新方法，通过引入配体-受体相互作用成本来模拟细胞间通讯，增强了对scRNA-seq轨迹推断的最优传输，改进了对齐并实现了可解释的计算机模拟扰动。