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先探后编:基于探针引导的LLM代理在基于结构的药物设计中的分子优化

arXiv cs.AI · 2天前 缓存

本文介绍了 PROBE,一个利用 LLM 代理通过在编辑前探测口袋-配体复合物响应来迭代优化基于结构的药物设计中的配体的框架,其在 CrossDocked2020 上取得了最先进的结果。

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结构蛋白质组学引导的共折叠模型

arXiv cs.LG · 2026-05-27 缓存

介绍了AIMS-Fold,一种推理时引导扩散框架,整合了交联质谱(XL-MS)和氢-氘交换(HDX-MS)数据,以改善针对诱导接近药物靶点的蛋白质共折叠预测。

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解读细胞,设计疗法:基于扰动条件的分子扩散用于功能导向药物设计

arXiv cs.LG · 2026-05-18 缓存

本文正式将基于转录组的药物设计(TBDD)形式化为一个生成式逆问题,并提出了CURE——一个多分辨率转录组引导的扩散框架,能够生成以所需转录组状态转变为条件的药物分子。

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