perturbation

Arc Institute的PerturbSpace利用标准单细胞测序，可在一天内从多个样本中实现转录组、位置、CRISPR向导、克隆关系及表面蛋白的高通量单细胞分析。

本文识别了文档布局分析鲁棒性评估中的足迹偏差，并提出了一种结构感知的审计框架，该框架解耦了探针构建与路径归因，表明小规模的结构定向探针会导致与较大扰动相当的下游性能退化。

# 论文页面 - 单细胞CRISPR扰动的几何一致性揭示调控架构并预测细胞应激 来源：[https://huggingface.co/papers/2604.16642](https://huggingface.co/papers/2604.16642) ## 摘要 尽管基因组工程在序列层面已达成卓越精度，预测扰动后细胞将占据的转录组状态仍是未解难题。单细胞CRISPR筛选可测量细胞偏离未扰动状态的程度，但这一效应幅度忽略了一个根本问题：细胞是否协同移动？若一个扰动将细胞沿共同轨迹一致推进，而另一个将其分散到表达空间各处，即使幅度相同，结果也可能截然不同。