@arcinstitute: 大多数空间CRISPR筛选需要在通量或读取深度之间进行权衡。来自@alexnevue、@Inna_Av…

X AI KOLs Timeline 论文
spatial-crispr preprint perturpspace genomics single-cell transcriptomics

摘要

来自Arc Institute的一篇新预印本介绍了PerturbSpace，这是一种空间分辨、多模态全转录组CRISPR筛选方法，与标准单细胞工作流程兼容。

大多数空间CRISPR筛选需要在通量或读取深度之间进行权衡。来自@alexnevue、@Inna_Averbukh、@Davidlarastiaso及其团队的一篇新预印本介绍了PerturbSpace：在标准单细胞工作流程上进行空间分辨、多模态全转录组分析。https://t.co/hXb529faJ2
查看原文
查看缓存全文

缓存时间: 2026/05/27 05:18

大多数空间CRISPR筛选需要在通量或读取深度上做出权衡。来自@alexnevue、@Inna_Averbukh、@Davidlarastiaso团队的一篇新预印本介绍了PerturbSpace：在标准单细胞工作流程上实现空间分辨、多模态、全转录组分析。https://t.co/hXb529faJ2

相似文章

单细胞CRISPR扰动的几何一致性揭示调控架构并预测细胞应激

Hugging Face Daily Papers

# 论文页面 - 单细胞CRISPR扰动的几何一致性揭示调控架构并预测细胞应激 来源：[https://huggingface.co/papers/2604.16642](https://huggingface.co/papers/2604.16642) ## 摘要 尽管基因组工程在序列层面已达成卓越精度，预测扰动后细胞将占据的转录组状态仍是未解难题。单细胞CRISPR筛选可测量细胞偏离未扰动状态的程度，但这一效应幅度忽略了一个根本问题：细胞是否协同移动？若一个扰动将细胞沿共同轨迹一致推进，而另一个将其分散到表达空间各处，即使幅度相同，结果也可能截然不同。

CellBRIDGE: 通过交互感知对齐学习细胞轨迹

arXiv cs.LG

CellBRIDGE是一种新方法，通过引入配体-受体相互作用成本来模拟细胞间通讯，增强了对scRNA-seq轨迹推断的最优传输，改进了对齐并实现了可解释的计算机模拟扰动。