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基于内存高效等变变压器的可扩展肽设计

arXiv cs.LG · 16小时前 缓存

介绍了MEET,一种用于全原子肽设计的内存高效E(3)等变变压器,与VAE和潜在扩散管道集成,实现了线性内存缩放和改善的生成质量。

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面向化学语言模型的不确定性感知强化学习

arXiv cs.LG · 16小时前 缓存

提出了两种互补方法,将预测不确定性融入化学语言模型的强化学习中,提高了鲁棒性,并在从头分子设计中将真实命中率提升了0.25。

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Sesame: 通过空间密度图条件的结构感知分子生成

arXiv cs.LG · 昨天 缓存

本文介绍了Sesame,一个基于扩散的分子生成模型,该模型通过空间密度图对部分分子结构和蛋白质口袋进行条件化,从而实现从头生成和片段条件的先导化合物优化,用于药物设计。

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TxBench-PP:分析AI代理在小分子临床前药理学上的表现

arXiv cs.AI · 2026-06-18 缓存

TxBench-PP是一个用于评估AI代理在小分子临床前药理学任务上表现的基准测试。在16种模型-框架配置中,最佳系统仅达到59.3%的准确率,表明仍有很大的改进空间。

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@OpenAI:Maria 在 10,080 次反应中测试了这个想法,随后人类化学家手工验证了代表性结果。在……

X AI KOLs · 2026-06-17 缓存

OpenAI 与 Molecule.one 合作,让他们的 AI 系统(GPT-5.4 和 Maria)自主选择研究领域、生成提案并在有机化学中运行实验,实现了 88% 测试反应的产率提升——这是 AI 驱动的开放式科学发现的首次。

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@OpenAI: GPT-5.4 帮助推动了一个药物化学项目,从文献综述到验证的实验结果。与…

X AI KOLs · 2026-06-17 缓存

GPT-5.4 与 Molecule.one 的 Maria AI 平台合作,自主推动了一个药物化学项目,从文献综述到验证的实验结果,提出了对药物发现中广泛应用的反应的意外改进。

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一种近乎自主的AI化学家改进了药物化学中的一个挑战性反应

OpenAI Blog · 2026-06-17 缓存

OpenAI将GPT-5.4连接到自主化学AI(Maria)以改进伯磺酰胺的Chan-Lam偶联反应,在药物化学反应中实现了显著的产率提升。

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介绍 LifeSciBench

OpenAI Blog · 2026-06-17 缓存

OpenAI 推出 LifeSciBench,这是一个包含 750 个专家编写任务的基准测试,用于评估 AI 系统在现实生命科学研究工作流中的表现,包括证据处理、分析和科学推理。

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黑箱药物-靶点相互作用预测模型的关注点:跨方法可解释性

arXiv cs.LG · 2026-06-15 缓存

一项研究对BridgeDPI药物-靶点相互作用模型进行了跨方法可解释性审计,结合基于梯度的归因和遮挡方法,揭示了模态主导性和伪影,为药物发现提供了可检验的假设。

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曲率感知势能面用于蛋白质-配体结合亲和力预测

arXiv cs.LG · 2026-06-15 缓存

本文提出CPES,一种曲率感知势能面图神经网络,用于蛋白质-配体结合亲和力预测。它整合了物理启发的曲率表示来建模构象灵活性,并在基准数据集上实现了改进的预测性能。

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曲率引导的几何表示用于蛋白质-配体结合亲和力预测

arXiv cs.LG · 2026-06-15 缓存

本文提出RicciBind,一种集成里奇曲率和最优传输的几何表示框架,用于蛋白质-配体结合亲和力预测,在多个基准测试中展示了卓越的准确性和可解释性。

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APCyc:通过自动化环化进行性质导向的环肽设计

arXiv cs.AI · 2026-06-12 缓存

APCyc是一个靶点感知的生成框架,通过显式建模环化模式并利用贝叶斯后验引导,设计具有可控理化性质的环肽。

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MDForge:稀疏模拟器反馈下的智能体分子动力学流程设计

arXiv cs.AI · 2026-06-12 缓存

MDForge 是一个 LLM 智能体,可自动化设计用于主客体结合自由能计算的分子动力学流程,取得了与人类专家相当的结果,并发现了一种新型高亲和力结合物。

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用于多任务ADME性质预测的概率对比预训练

arXiv cs.LG · 2026-06-11 缓存

本文提出了一种用于分子图变换器的概率对比预训练框架,以改善药物发现中的多任务ADME性质预测,在三个基准上取得了显著提升。

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GLACIER: 一种用于分子性质预测的多模态学生-教师基础模型

arXiv cs.LG · 2026-06-11 缓存

本文介绍了GLACIER,一种多模态学生-教师基础模型,它整合了分子图、SMILES字符串和物理化学描述符,以高效预测分子性质。它利用Finsler几何感知融合以及来自更大教师模型(MiniMol、MolFormer)的知识蒸馏,以轻量级架构实现高性能。

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@kavi_deniz: 我们自豪地宣布,@TamarindBio 已被选为构建、托管和运营推理基础设施层…

X AI KOLs Following · 2026-06-10 缓存

TamarindBio 已被选中为礼来公司(Eli Lilly)的协作式 AI/ML 药物发现平台 TuneLab 2.0 构建、托管和运营推理基础设施层。

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'世界首个'由人工智能设计的疫苗

Reddit r/singularity · 2026-06-05

一款世界首创的疫苗使用人工智能设计而成,标志着人工智能在医疗和制药开发领域应用的一个重要里程碑。

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GPT-Rosalind 新增功能发布

OpenAI Blog · 2026-06-03 缓存

OpenAI 推出了专为生命科学研究设计的更新版 GPT-Rosalind 模型,在药物化学、基因组学和药物发现流程方面性能提升,并引入了 LifeSciBench 和 MedChemBench 等新基准。

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CP-Agent: 面向化学扰动下细胞形态轮廓分析的情境感知多模态推理

arXiv cs.AI · 2026-06-03 缓存

CP-Agent 是一个多模态大语言模型,它利用情境感知对齐(CP-CLIP)来解释化学扰动下的细胞形态变化,从而为药物发现提供可解释且可扩展的表型筛选。

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@GoogleDeepMind:过去一年,我们与全球科学专家合作,评估系统在复杂问题上的表现。它……

X AI KOLs · 2026-06-02 缓存

GoogleDeepMind与全球科学专家合作,评估了一个AI系统,该系统识别了肝纤维化的新靶点,并为肌萎缩侧索硬化症(ALS)找到了新的方法,消化了数十年的研究成果。

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