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本文提出在类似BiomeGPT的特征标记化Transformer中使用有符号、融合感知的集成梯度来进行预测归因,克服了CLS注意力权重的局限性,并揭示支持疾病与保护性微生物信号。
东南大学的一项研究发现,像Ozempic这样的GLP-1药物通过促进德氏乳杆菌的生长来逆转小鼠的抑郁样行为,该菌产生内源性大麻素,从而减少应激影响。
本文评估了表格基础模型在微生物组数据中受生物学启发的分布偏移下的鲁棒性,发现保护判别特征不足以保证稳定性,且零填充是最有害的扰动。
本文介绍了PolyILR,一种与任意树拓扑对齐的Aitchison切空间的正交归一分解,为诸如微生物组和单细胞谱等成分数据提供了稳定且可解释的特征。